株式会社ジーンデザイン

		ICONプローブ配列設計のポイント
		１．他のメチル化部位の配列に対応しないかご確認下さい。２．プローブ同士が反応温度でハイブリダイゼーションを起こさないように　　配列をずらして設計してください。３．ＩＣＯＮプローブは目的のメチル化候補に対してセンス鎖用、アンチセンス　　鎖用の各１配列を用意します。４．定量的ＰＣＲ等、アプリケーション中でＰＣＲを行う場合は、ＩＣＯＮプローブ　　を起点としたＤＮＡ合成が生じないように、あらかじめ３’末端にリン酸基　　修飾を付加しておくことが望ましいです。５．プライマーは、ＩＣＯＮプローブ結合領域を挟み込む形で設定してください。　　（下図参照）６．目的のメチル化領域内に複数のメチルシトシンが存在する場合でも、対応　　する修飾ヌクレオチドは１ヶ所を設定していただければ検出可能です。　　複数挿入は2本鎖の安定性が落ちるため推奨いたしません。　　（ICONプローブセットは修飾ヌクレオチド1ヶ所挿入となります。複数の修飾　　　ヌクレオチド挿入希望の場合はカスタムICONプローブ扱いとなります）７．プローブの長さは反応・定量のいずれの工程にも原理的には影響しま　　せん。モデル配列長は２０merです。８．修飾ヌクレオチドを挿入する位置は自由に選んでいただけますが、モデル　　配列としては　　5'- ４base-Ｘ-１５base -3'　がございます。

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